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预测hpv相关性头颈癌患者的预后

2019-01-12

  通过分析头颈癌中人乳头瘤病毒(HPV)水平的变化,德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员发现了一种与患者的治疗反应和生存相关的基因特征。这种生物标志物不仅可以简单地将肿瘤分类为HPV阳性或HPV阴性,而且有朝一日可以使临床医生更好地预测患者的预后,最终可以降低治疗强度,从而将严重的副作用降至最低。

  发表在《JCI Insight》上的这项研究确定了部分头颈部或口咽部hpv阳性癌症患者,这些患者的分子结构和生存率与hpv阴性癌症相似,但通常预后较差。研究人员发现了一个基因小组来区分这一亚群,并且在多个独立的群组中似乎可以预测结果。

  HPV阳性口咽癌的标准治疗是化疗和放疗的组合,五年生存率约为85%,而HPV阴性癌仅为55%,Curtis Pickering博士解释说,他是助理教授。头颈外科及相应作者的研究。

  “患有HPV阳性口咽肿瘤的患者在放射治疗后存活很长时间,但往往留下严重的长期发病率,包括言语或吞咽问题,”Pickering说。“因此,临床医生希望减少或降低治疗,以减轻严重的副作用。但是,我们目前没有良好的生物标志物来安全地确定哪些患者是降级的候选人。”

  为了更好地了解HPV生物学在患者预后中的作用并确定与治疗反应相关的生物标志物,研究小组分析了癌症基因组图谱(TCGA)中包含的80种口咽癌的数据。研究人员不是简单地将肿瘤分类为HPV阳性或HPV阴性,而是根据HPV基因表达水平检查所有肿瘤。

  “这使我们得到了一个表达标记,整齐地识别出HPV阳性患者中的两个不同组,”Pickering说。“HPV阴性肿瘤明显不同,但在HPV阳性内有两个不同的组。这在生物学上很有意义,但一个HPV阳性亚组的存活率与HPV阴性患者相似。”

  研究人员发现了一个由582个基因组成的初始小组,它们区分了这三个亚组 - 高HPV组,低HPV组和HPV阴性组 - 各自具有统计学上显着的存活差异。进一步的分析导致了一组只有38个能够区分两个HPV阳性亚组的基因。

  各种遗传分析证实了这些组之间的区别,研究人员发现了两种通常不被认为对肿瘤进展很重要的病毒基因,这些基因在HPV阳性组之间存在显着差异。此外,细胞系研究表明这些基因与辐射敏感性相关,与患者中看到的反应一致。

  认识到该基因特征在预测治疗反应方面的潜在价值,研究人员评估了两个独立的HPV相关口咽癌和宫颈癌患者队列中的生物标志物。在每种情况下,基因组似乎是存活的预后并且比可用的临床因素(例如吸烟状态和肿瘤大小)表现更好。在进一步完善基因组后,研究人员认为生物标志物可以减少到具有相似预后能力的单个基因。

  “我希望我们发现HPV生物学的一些新的基本方面与致癌过程,肿瘤的进展和对治疗的反应有关,”Pickering说。“如果我们能够在未来的研究中验证这一点,那么在几种与HPV相关的肿瘤类型中,它可能具有令人难以置信的临床应用价值。”

  目前的回顾性研究受到相对较小的队列规模和对RNA测序数据的依赖的限制,香港治疗癌症,因此,研究小组希望在开发出足以用于临床的分析后,在前瞻性试验中评估其生物标志物。

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