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恶性肿瘤基因组分析的重要性

2019-01-10

  俄亥俄州立大学综合癌症中心Arthur G. James癌症医院和Richard J. Solove研究所(OSUCCC-James)的一项新研究强调了对基因不稳定且有大量基因突变的罕见恶性肿瘤进行基因组分析的重要性。

  OSUCCC-James的研究人员分析了9个转移性肿瘤的基因组,以及一名罕见的癌症类型为指间树突状细胞肉瘤的已故患者的预处理原发肿瘤。这种疾病没有标准的治疗方法。

  这些样本是通过尸体捐献和尸检研究获得的。尸体解剖是在死亡后3小时内进行的,最大限度地减少了死后的分子变化。

  分析显示所有肿瘤均超突变。也就是说,癌细胞每一百万个DNA碱基有一百多个基因突变。超突变的癌症往往对免疫治疗有反应,但该患者的癌症在经过两个疗程的免疫治疗和靶向药物治疗后仍在继续进展。

  此外,研究人员在肿瘤样本中确定了6个恶性细胞亚群,并发现了3个突变特征。他们还将基因突变分为所有、部分或单个肿瘤中的突变。这些包括肿瘤抑制基因的点突变和癌基因可能的驱动突变。

  “这项研究说明了如何与患者建立特殊的伙伴关系,从而使研究具有侵袭性的罕见癌症成为可能,”首席研究员兼通讯作者Sameek Roychowdhury博士说,他是医学肿瘤学、精准癌症医学和基因组学副教授。“我们希望,随着研究的不断深入,这项研究将使我们能够描述癌症的复杂情况,并在此基础上开发新的治疗方法。”我们已经向我们的病人和他们的家人做出了这个承诺。

  Roychowdhury补充说:“这些发现具有重要的临床意义。”“表现出超超突变的癌症患者往往受益于免疫治疗,但我们的研究表明,仍需要进行研究,以确定哪种免疫疗法最适合每个患者。”

  在本研究中,我们从受影响的器官中收集了24个转移瘤样本。在病人死亡前进行的CT扫描指导了肿瘤样本的采集。对其中9个样本和预处理样本进行全外显子组测序。

  所有10个肿瘤位点均显示超超突变率。其他主要发现包括:

  1.在所有10个样本中鉴定出的7400多个体细胞变异被分为三类:在所有肿瘤样本中检测到的,在样本子集中检测到的,以及在一个肿瘤样本中检测到的个体变异。

  2.构建了肿瘤细胞多样性的肿瘤进化树。

  这名患者的尸检结果是OSUCCC - James癌症研究捐赠机构首次公布的分子结果之一。该研究是积极的,并接受病人的转介。其目的是更好地理解侵袭性、耐治疗的癌症。

  “身体捐赠为我们研究癌症生物学提供了前所未有的能力,”医学肿瘤学高级研究员、医学博士陈慧子说。香港治疗癌症,“除此之外,我为能在病人死后照顾他们感到荣幸和荣幸,我们这些进行这项研究的人致力于从他们的特殊天赋中学习我们所能学到的一切,并帮助他人。”

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