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基因水平帮助预测结直肠癌的预后

2019-04-15

  佐治亚州医学院的研究人员报告说,有助于免疫系统区分好细胞和坏细胞的基因水平可能是结直肠癌患者预后的良好指标。

  纵观15 个基因已知与相关的大肠癌 -eight与较小的关联生存率和七个具有较高的研究人员发现一种基因,CCR4,存在于更高水平的患者预后良好,即使在那些被诊断为晚期阶段性疾病。

  该基因是趋化因子家族的一部分,该家族参与贩运人体的白细胞,然后对抗入侵者。MCG的二年级学生Chance Bloomer表示,通过基因分析,MCG研究人员发现,治疗效果更好的患者对治疗反应更好,缓解发生率更高,寿命更长。

  “如果癌症正在表达这种基因,它就会使免疫系统更容易攻击这些细胞,”他说。“没有好的结肠直肠癌,但如果你想要它,你需要更高水平的这种基因。” 布鲁默本周在亚特兰大的美国癌症研究协会年会上发表了他的研究结果。

  Bloomer与分子病理学家兼MCG乔治亚神秘与分子实验室主任Ravindra Kolhe博士共同设计了两个遗传小组,他希望这两个遗传小组可用于预测良好结果,一个用于较差的结果。他们首先梳理cBioPortal for Cancer Genomics,其中包含大规模癌症基因组学数据集。

  “基本上这是原始数据,”Bloomer说。“数千名患有各种类型癌症的患者有数千种基因表达水平。我一直在寻找与更高存活率相关的基因。”

  Bloomer从近800个基因开始 - 所有这些基因都与癌症进展有着明显的联系 - 并且将这些基因缩小到38个,与结肠癌的存活率增加或降低显着相关。他通过对具有相似机制的人进行分组来进一步缩小该群体 - 例如,他们是否参与免疫系统反应,肿瘤生长率或治疗反应。“我希望采用整体方法来研究肿瘤遗传学以及这些基因是如何起作用的,”他说。

  在确定了8个基因小组后,他希望能帮助确定降低的存活率,并通过7个基因小组来确定更好的存活率,他们分析了乔治亚癌症中心的750名结肠直肠癌患者的组织样本。根据肿瘤分期对患者进行分组,通过使用其大小和/或是否已经扩散来确定; 他们是否存活不到三年或三年以上; 肿瘤等级,衡量其生长和扩散的速度; 年龄超过或低于76岁。

  虽然整个小组的效果不如布鲁默所希望的那样好,但CCR4水平的增加确实显示出多种显着的相关性,预后更好,即使是4期癌症患者也是如此。香港治疗肿瘤,患有3期癌症和更高存活率的患者也具有比具有1期肿瘤和较差存活率的患者更高水平的CCR4。生存率较高的年轻患者的生存率也高于生存率较低的患者。

  Bloomer说:“我们不完全确定这种联系是什么,但这是下一步。”“如果我们能够设计一个能够预测预后的小组,并且我们能够告诉人们,他们的预后可能更差,也许这有助于证明更积极的治疗是合理的,因为这种治疗可能会让人感到不舒服,并伴有更严重的副作用。但重要的是,我们要告诉病人,他们的结果并不确定。”
 

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